Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CXCL3P19876 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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