Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms