Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms