Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLK3P07288 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms