Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms