Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms