Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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BIVM-ERCC5R4GMW8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
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BIVM-ERCC5R4GMW8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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