Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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