Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms