Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms