Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms