Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms