Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms