Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms