Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C18orf8Q96DM3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms