Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms