Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms