Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms