Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms