Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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