Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms