Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF5Q12774 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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