Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms