Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms