Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddr1Q03146 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms