Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms