Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPHP49418 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPHP49418 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMPHP49418 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMPHP49418 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMPHP49418 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPHP49418 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms