Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms