Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPOP42166 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPOP42166 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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