Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC26A3P40879 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms