Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18530 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18530 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms