Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOP08100 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOP08100 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOP08100 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms