Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPLO60437 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPLO60437 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPLO60437 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PPLO60437 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms