Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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