Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms