Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms