Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms