Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK19Q9BWU1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK19Q9BWU1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms