Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms