Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP3Q8WYN3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms