Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms