Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO4Q2I0M5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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