Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KNOP1Q1ED39 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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