Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZFHX3Q15911 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZFHX3Q15911 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZFHX3Q15911 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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