Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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