Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms