Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms