Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms