Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTN2Q02246 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms