Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms